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简述采用Chemoffice程序构建Gaussian程序输入文件的步骤。

简述采用Chemoffice程序构建Gaussian程序输入文件的步骤。

发布时间:2025-11-07 10:02:09
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答案:【计分规则】: 构建Gaussian程序输入文件的方法有多种,其中有一些方法是借助Chemoffice程序中Chem3D有一种保存文件为Gaussian输入文件的格式,能够比较简便地构建。具体步骤如下:(1)绘制分子的ChemDraw平面构型。采用Chemoffice2004中的ChemDraw 程序绘制化合物分子的平面构型,保存上述文件格式为*.cdx(系列化合物按异构体取代位置命名)。 (2)转换为空间坐标—高斯输入文件格式。采用Chemoffice2004中的Chem3D程序打开上述*.cdx文件,得到化合物分子的立体构型。选择“MM2”或“MOPAC”方法中的“Minimize Energy”对结构进行能量最小化计算,保存上述文件格式为*.gjf。 (3)空间坐标的获取。用记事本方式打开文件*.gjf,得到化合物的空间坐标。 (4)高斯输入文件的制作。用上述步骤得到的相应坐标替换高斯输入模板文件中的相应坐标,保存为*.txt,即为构建的高斯计算输入文件。
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