导致PCR出现假阴性，即PCR失败的原因主要有：

A、引物设计、合成或配置浓度出了问题;

B、生物样本出错，或者是DNA提取出了问题;

C、操作出问题，例如：试剂加错了、试剂忘加了或试剂失效了。;

D、PCR的反应程序设计出问题，例如：退火温度过高等。